A indústria de transformação também pode ser considerada a principal atividade industrial do Estado, se observado pela ótica do emprego: são 314 mil trabalhadores com carteira assinada e representatividade de 54% da atividade industrial fluminense. Trata-se do sexto maior complexo industrial brasileiro, pelos conceitos de VAB e de empregados.

A indústria da transformação é bastante diversificada e está presente em todas as regiões do Estado. O município do Rio de Janeiro pode ser considerado a capital industrial fluminense, por concentrar o maior número de empregados na indústria de transformação (117 mil) e em 19 de seus 24 segmentos industriais: Fabricação de Alimentos, Combustíveis, Vestuário, Borracha e Plástico, Farmacêutica, Bebidas, Gráfica, Máquinas, Químicos, Produtos de metal, Ópticos, Vidros, Têxteis, Artefatos de couro, Papel, Eletrônicos, Materiais elétricos, Fumo e Madeira.

De forma complementar, os cinco segmentos da indústria de transformação cujos maiores polos estão fora da capital fluminense são: Metalurgia em Volta Redonda, sede da uma grande usina siderúrgica; Veículos em Resende, com fabricantes de carros, caminhões e autopeças; Naval em Angra dos Reis, sede do maior estaleiro do Rio de Janeiro em operação; Móveis em Nova Iguaçu, com uma grande fábrica de colchões; e Manutenção industrial em Macaé, de plataformas e de maquinário para exploração de óleo e gás.

Mas o Estado do Rio de Janeiro possui outros importantes polos industriais, como destaque: Vestuário em Nova Friburgo (moda íntima e fitness) e Petrópolis; Bebidas em Petrópolis, Teresópolis, Piraí (cervejas) e Duque de Caxias (refrigerantes); Papel em Piraí e Santo Antônio de Pádua; Gráfica em Duque de Caxias; Refino em Duque de Caxias; Químico em Duque de Caxias (polímeros) e Nova Iguaçu (tecnologias não letais); Farmoquímica em Duque de Caxias; Borracha em Itatiaia (pneus); Plásticos em Duque de Caxias (embalagens); Minerais não-metálicos em Campos dos Goytacazes e Itaboraí (cerâmica); Metalurgia no Rio de Janeiro, Barra Mansa, Resende e Porto Real (siderurgia); Produtos de metal em Nova Friburgo (fechaduras) e Itaguaí (caldeiraria); Equipamentos de informática em Petrópolis (polo tecnológico); Ópticos em Petrópolis (lentes) e Valença (microscópios); Aparelhos elétricos em Itatiaia (eletrodomésticos); Máquinas e equipamentos em Macaé e Niterói (para extração de petróleo); Veículos e peças em Porto Real, Itatiaia (automóveis) e Nova Iguaçu (coletores captadores); Naval em Itaguaí (submarinos), Niterói e Rio de Janeiro; Móveis em Rio de Janeiro, Duque de Caxias (mobiliário) e Três Rios (colchões); Dispositivos médicos em São Gonçalo; Manutenção industrial em Petrópolis e Três Rios (turbinas de aeronaves); e instalação industrial em Volta Redonda.